Les prédateurs naturels des mocassins aquatiques comprennent :
- des poissons carnivores plus gros, comme le bar et le brochet
- de grands alligators et crocodiles
- des oiseaux de proie plus gros, comme les faucons et les aigles
- d'autres serpents, comme le serpent royal et le serpent indigo
- d'autres mocassins d'eau