Le Shih Tzu maltais pourrait être affecté par les problèmes de santé et maladies suivants (mais sans s'y limiter), dont certains sont héréditaires. Ce ne sont pas tous des problèmes de santé et des maladies à haut risque pour les Shih Tzu maltais. Certaines d'entre elles sont des maladies environnementales et peuvent donc être facilement évitées en donnant au Shih Tzu maltais les soins et l'attention appropriés.