Aussiedoodles pourrait être affecté par les conditions de santé et les maladies suivantes (mais sans s'y limiter), dont certaines sont héréditaires. Ce ne sont pas tous des problèmes de santé et des maladies à haut risque pour les Aussiedoodles. Certains d'entre eux sont des maladies environnementales et peuvent donc être facilement évités en accordant aux Aussiedoodles les soins et l'attention appropriés.