Les chiens d'eau portugais pourraient être affectés par les conditions de santé et les maladies suivantes (mais sans s'y limiter), dont certaines sont héréditaires. Ce ne sont pas tous des problèmes de santé et des maladies à haut risque pour les chiens d'eau portugais. Certains d'entre eux sont des maladies environnementales et peuvent donc être facilement évités en donnant aux chiens d'eau portugais les soins et l'attention appropriés.