Les border collies pourraient être affectés par les conditions de santé et les maladies suivantes (mais sans s'y limiter), dont certaines sont héréditaires. Ce ne sont pas toutes des conditions de santé et des maladies à haut risque pour les border collies. Certains d'entre eux sont des maladies environnementales et peuvent donc être facilement évités en donnant aux Border collies les soins et l'attention appropriés.