[Mise à jour le 10 janvier 2019]
Le séquençage du génome canin, réalisé en tant que projet de recherche publique en 2004, a ouvert les vannes à des possibilités infinies pour les tests génétiques canins. Le Saint Graal pour de nombreux scientifiques engagés dans ce travail est la compréhension et, finalement, l'élimination des maladies canines héréditaires. Pour de nombreux propriétaires de chiens, cependant, le résultat le plus excitant de ce travail sérieux est la possibilité qu'ils puissent apprendre exactement de quelles races sont faits leurs cabots.
Bien qu'il existe déjà plusieurs sociétés commerciales proposant des produits qui prétendent pouvoir faire exactement cela, notre évaluation des tests d'identification de race est que les résultats peuvent être tout aussi mitigés que les chiens qu'ils cherchent à expliquer. Les résultats des tests peuvent être presque aussi variés, intéressants et agréables que nos amis métis, mais il semble que, du moins pour le moment, ils ne soient peut-être pas en mesure de répondre de manière absolue à la question de la filiation de votre chien. Les tests s'améliorent chaque jour, cependant! Et à mesure que la compréhension de l'ADN, la taille des bases de données d'échantillons et la puissance des ordinateurs augmentent, il est probable que les tests seront, à un moment donné, vraiment à la hauteur du battage publicitaire actuellement utilisé pour les vendre.
Tests de race de chien :une histoire
Le premier test ADN de race mixte est né dans le laboratoire d'Elaine A. Ostrander, Ph.D., et Leonid Krugylak, Ph.D., lorsqu'ils étaient au Fred Hutchinson Cancer Research Center à Seattle. Drs. Ostrander et Krugylak recherchaient des points communs génétiques entre les chiens de race pure reconnus par l'American Kennel Club (AKC). L'un des objectifs était de découvrir les gènes responsables de maladies communes aux chiens et aux humains, dont plusieurs types de cancer. Ils étudiaient également la parenté d'environ 100 des races reconnues par l'AKC; cela a conduit à la découverte que la variation génétique entre les races de chiens est beaucoup plus grande que la variation au sein des races. À titre de comparaison, la variation génétique entre les populations humaines est d'environ 5,4 % ; chez les chiens, ont-ils découvert, la variation entre les races est estimée à 27,5 %.
En 2005, Ostrander et Krugylak ont signé un accord de commercialisation avec Mars Veterinary ™, une division nouvellement créée du puissant Mars, Incorporated (oui, pensez aux bonbons, gommes, aliments pour animaux de compagnie et autres produits alimentaires), licenciant la technologie qu'ils ont développée pour une utilisation dans la race pièce d'identité.
Mars Veterinary n'était pas seul dans la course pour commercialiser un produit d'identification de race. Les scientifiques de MMI Genomics Inc. (MMIG) étudiaient également l'ADN canin. En fait, MMIG a fourni des services de vérification d'identité et de filiation pour l'AKC, le United Kennel Club (UKC), le Professional Kennel Club (PKC) et un certain nombre d'autres registres canins et clubs de race. MMIG était à l'origine une division de Celera et a dirigé l'effort privé de séquencer le génome canin. Il a également été le premier à commercialiser un test d'identification de race, en mars 2007. MMIG a appelé son produit le Canine Heritage™ Breed Test. Lors de ses débuts commerciaux, le test n'était potentiellement capable d'identifier que 38 races; le test ("XL") a été mis à jour à la mi-2008 pour identifier plus de 100 races.
Mars Veterinary a lancé son test sur le marché quelques mois plus tard, en septembre 2007, sous le nom de test Mars Veterinary Wisdom Panel™ MX.
Comment fonctionnent les tests ADN pour chiens ?
Chaque entreprise fait la promotion de ses tests en disant qu'ils sont un bon moyen pour le propriétaire d'un chien de race mixte de savoir si son chien pourrait être sensible à une maladie génétique particulière si le chien a des races connues pour hériter de certaines conditions. Ils disent également que les tests aident à la formation, en donnant au propriétaire un aperçu du comportement du chien; la raison pour laquelle le chien agit comme il le fait pourrait s'expliquer par son passé. En fin de compte, cependant, les représentants de l'entreprise admettent que la majorité de leurs clients achètent les tests simplement par curiosité et parce que c'est amusant à faire.
Les tests ADN que nous avons examinés tirent leurs bases de données de plus de 160 races reconnues par l'AKC et ne concernent que les races trouvées en Amérique du Nord. Dans le monde, on estime qu'il existe plus de 300 races de chiens.
Les tests utilisent des outils génétiques appelés « marqueurs » pour définir le concept de race canine. Un marqueur génétique est une position dans le génome où il existe une variabilité dans la séquence qui est héritée, suivant les règles de la génétique classique. Deux types courants de marqueurs sont les microsatellites et les polymorphismes nucléotidiques simples (SNP).
Chaque entreprise a développé indépendamment un ensemble de marqueurs qui définissent les races dans leurs bases de données et utilise des algorithmes informatiques sophistiqués pour faire correspondre l'ADN d'un chien de race mixte à celui de sa base de données afin de trouver la ou les meilleures correspondances de race pour lui. L'analyse détermine à quel point et dans quelle mesure les modèles génétiques du chien de race mixte correspondent à ceux des chiens de race pure.
Il existe deux acteurs très importants sur le marché américain (MMIG et Mars Veterinary) et quelques-uns qui tentent de se tailler un rôle plus important. EDP BioTech Corp. est tout nouveau; une quatrième société, DNA Diagnostics Center Veterinary, sous-traite son travail à EDP BioTech Corp. Il existe au moins un test (Viaguard DNAffirm™) proposé par une société canadienne, Accu-Metrics Ltd., que nous n'avons pas exploré.
Mars Veterinary Wisdom Panel™
Le Wisdom Panel MX était le seul test ADN mixte à nécessiter un échantillon de sang. Initialement disponible uniquement auprès des vétérinaires, le test est désormais disponible en ligne directement auprès de Mars Veterinary, ainsi que auprès des vétérinaires et de certains détaillants de fournitures pour animaux de compagnie. Il a un prix de détail suggéré de 125 $, qui comprend la livraison gratuite si commandé directement auprès de Mars Veterinary. Néanmoins, une visite chez le vétérinaire de votre chien est toujours nécessaire pour une prise de sang, ce qui signifie un coût supplémentaire pour la visite et la procédure du cabinet vétérinaire, et un stress possible pour votre chien s'il n'aime pas le cabinet vétérinaire.
L'AKC reconnaît 161 races; la base de données Mars Veterinary comprend 153 races AKC dans sa base de données, plus quatre races en attente de reconnaissance par AKC, pour un total de 157 races. Pour développer sa base de données, Wisdom Panel a typé plus de 13 000 chiens lors du développement des tests, réalisant plus de 19 millions d'analyses de marqueurs génétiques. La base de données de Mars Veterinary est la plus importante des trois sociétés que nous avons examinées, mais son test est également le plus coûteux.
Après avoir extrait l'ADN de l'échantillon de sang, des SNP uniques - ou de légères variations dans la composition de l'ADN - sont identifiés. Le test examine 321 points ou marqueurs où des variations sont trouvées, cherchant à former des modèles spécifiques à la race. Un algorithme propriétaire est ensuite exécuté sur les données.
Angela Hughes, DVM, généticienne vétérinaire et consultante pour Mars Veterinary, l'explique en disant que l'ordinateur "dit" alors qu'il regarde l'ADN d'un chien en particulier, "Si je dois lui faire une chose, quel serait le meilleur match? Si deux, qu'est-ce qu'elle correspondrait, puis trois, puis ainsi de suite, jusqu'à huit. Le résultat est alors un score statistique pour chaque « arbre » que le programme construit, indiquant comment ce chien correspond le mieux. » Huit est le nombre magique car le niveau de confiance de Mars Veterinary est de remonter à trois générations (huit arrière-grands-parents).
La société affirme que le test détermine la composition de la race avec une précision de 90 %, définissant cela comme un test de validation qui a abouti à une précision moyenne de 90 % chez les chiens croisés de première génération de parenté connue (nous soulignons).
Comme pour le test concurrent Canine Heritage, les résultats du Wisdom Panel sont rapportés dans trois catégories, seul Mars Veterinary les appelle les races significatives, intermédiaires et mineures, ce qui se traduit approximativement par parent, grand-parent et arrière-grand-parent. Pour qu'une race soit répertoriée comme significative, au moins 50% de l'ADN du chien doit provenir de cette race (c'est-à-dire que l'un des parents était de race pure ou peut-être que les deux grands-parents étaient de la même race); Intermédiaire, au moins 25 % ; et Mineure, au moins 12,5 %.
Mars Veterinary s'attend à ce que si votre chien montre une race significative, il affichera probablement certains traits physiques et comportementaux de cette race, à moins que certains des gènes ne soient récessifs. Pour Intermédiaire, vous "pourrez" voir certains traits physiques et comportementaux de cette race chez votre chien, et pour Mineur, il est peu probable que les traits physiques de la race soient visuellement représentés chez le chien à moins que certains des gènes ne soient dominants.
La société cite un délai de deux à trois semaines sur les résultats des tests; l'état du test peut être suivi en ligne - et les résultats, lorsqu'ils sont prêts, seront envoyés par la poste au client mais seront disponibles en ligne plus tôt. La seule information de contact de l'entreprise qui est proposée sur le site Web est une adresse e-mail; aussi inutile soit-il, le site Web lui-même offre des tonnes d'informations.
Lorsque nous avons trouvé un numéro de téléphone pour joindre l'entreprise, le représentant qui a répondu a été modérément utile, bien qu'il ait été plus disposé à traiter avec quelqu'un appelant pour discuter des résultats du test de son chien qu'avec quelqu'un recherchant des informations détaillées sur l'entreprise et ses produits.
Voir les produits de Wisdom Panel ici.
Laboratoire vétérinaire BioPet / PooPrints
Le dernier venu sur le marché est le test ADN Breed ID proposé par BioPet Vet Lab, une division d'EDP Biotech Corp. BioPet Vet Lab lui-même a été créé fin 2007; son test ADN canin a été lancé début 2008 via des revendeurs en ligne. En plus du test d'identification de la race, BioPet propose également des tests ADN de preuve de filiation, l'identification ADN de l'animal et le très intéressant programme PooPrints™ ("match the mess through DNA").
L’objectif de l’entreprise est d’offrir un test solide et abordable. Il espère y parvenir en limitant le nombre de races dans sa base de données à 63 – ce qui, selon la société, représente «environ 93% de l'ADN de chien qui se trouve aux États-Unis selon les tendances historiques de la popularité des races» – et en fixant le prix du test à 60 $. . L'ajout de races supplémentaires nécessite l'ajout de plus de marqueurs, ce qui augmente le coût ; BioPet suggère qu'il complétera très probablement sa base de données à 65 à 70 races. Ce test utilise également un frottis buccal pour collecter l'ADN d'un chien.
La société vend ses tests via PetSmart, Pet Supermarket, d'autres détaillants et des détaillants en ligne. Le délai d'obtention des résultats est d'environ deux semaines et il ne semble pas que l'entreprise dispose d'une capacité de suivi en ligne de l'état des tests. Ils réexécuteront un test sur demande, reconnaissant la possibilité d'une erreur humaine, mais la porte-parole de la société, Meg Retinger, a indiqué que même dans ceux qu'ils ont réexécutés, ils n'ont jamais vu un résultat de test complètement différent lors de la deuxième exécution. Le site Web de BioPet contient une quantité modérée d'informations et le porte-parole de l'entreprise a été utile.
Consommateurs heureux de tests ADN pour chiens de race mixte
Ruby, du nom de son manteau rouge court, a été ramenée à Rosalie et Leonard Sanchez de Riverside, en Californie, par leur petit-fils de 15 ans, qui l'a obtenue d'une dame qui distribuait des chiots à l'arrière d'une camionnette. La dame a dit à leur petit-fils que le chiot était un mélange de Saint-Bernard. Rosalie a rapidement rejeté ses paroles, pensant qu'il avait inventé cette partie de l'histoire, car Ruby ne ressemblait en rien à un Saint-Bernard.
Au début de cette année, elle a entendu parler du test Canine Heritage et était curieuse d'en savoir plus sur les antécédents de Ruby. Elle et son mari ont deviné que Ruby faisait partie de Boxer. Leur vétérinaire était d'accord, à cause des grandes pattes de Ruby; sa conjecture était Boxer/Great Dane ou Boxer/Mastiff.
Lorsque les résultats sont revenus, Rosalie a été terrassée; son petit-fils avait raison après tout ! Le test a montré Boxer et Saint-Bernard. Bien qu'elle n'arrive toujours pas à comprendre à quel point Ruby ne ressemble pas à un Saint-Bernard, Rosalie dit :« Un chien de race mixte est comme une boîte de chocolats. On ne sait jamais ce qu'il y a à l'intérieur."
La petite amie de Dan McCarthy a trouvé Flora allongée à côté d'un arrêt de bus, émaciée et couverte de puces. Leur vétérinaire pensait que Flora était un mélange de Labrador et Springer Spaniel, mais elle était de petite taille, pesant 30 livres à l'âge de deux ans. D'autres personnes ont deviné Border Collie et Jack Russell Terrier.
Dan, un résident d'Hollywood, en Californie, voulait en savoir le plus possible sur Flora. "Je veux savoir qui étaient sa mère et son père, où ils sont maintenant, et leur montrer que Flora a grandi pour devenir un super chien avec une belle vie", dit-il. L'été dernier, il a commandé le test Canine Heritage. Les résultats ont montré que les parents de Flora n'étaient probablement pas de race pure - rien n'est répertorié dans la catégorie Primaire, comme Dan l'avait soupçonné. Le niveau secondaire, cependant, a signalé le berger allemand et le cocker. Dan était étonné. "L'épagneul explique pourquoi elle est si petite, et le berger explique pourquoi elle est si intelligente !"
Kitty Cannon de Crystal Beach, en Floride, et son mari avaient toujours joué à un jeu de devinettes sur le maquillage de la race de leur chien. Lorsqu'ils ont entendu parler des tests ADN en 2008, Kitty s'est dit :« Pourquoi pas ? Puisque nous ne pouvons pas nous permettre de faire cloner Fox, peut-être qu'en connaissant ses races, nous pourrons à l'avenir chercher un autre grand chien avec ses traits. Ils ont deviné que Fox faisait partie de Collie ou de Sheltie. Lorsque leurs résultats Canine Heritage sont revenus, ils ont été surpris d'avoir Bernese Mountain Dog dans la catégorie Secondaire et Chow Chow "In the Mix". Seul un être supérieur saurait avec certitude si les résultats sont exacts, dit Kitty, "mais nous remarquons certaines similitudes quant à l'endroit où il a obtenu sa couleur de fourrure, la forme de ses oreilles et sa ligne de bajoues. Nous savons qu'ils ont brisé le moule avec lui et qu'il n'y en aura jamais d'autre."
Evelyn Orenbuch, une vétérinaire de Philadelphie, a commandé le Mars Veterinary Wisdom Panel MX pour son chien de sauvetage, Pia. "Je voulais savoir si le comportement de Pia avait quelque chose à voir avec les races que je pensais qu'elle avait en elle. Nous avons deviné Border Collie, Whippet et… ? » Les résultats ne correspondaient qu'aux niveaux les plus bas, révélant le berger allemand et quelques autres races. Le Dr Orenbuch a été quelque peu déçue, car elle avait espéré avoir plus d'informations sur l'origine de Pia. Néanmoins, elle dit qu'elle recommanderait le test aux clients. « Connaître les races de votre chien vous aide à comprendre ses aspects émotionnels et physiques. Cela ne changera peut-être pas ce que vous faites avec votre chien ou la façon dont vous le traitez, mais cela peut vous aider à le comprendre."
Critiques et limites des tests de race
Le Wisdom Panel (produit Mars Veterinary) a été critiqué car il nécessite une visite chez un vétérinaire et une prise de sang. Cela augmente le coût des tests et pourrait stresser les chiens réfractaires aux vétérinaires. Les critiques suggèrent également que les échantillons de sang peuvent être endommagés lors du transport vers le laboratoire.
Mars Veterinary défend sa décision d'utiliser du sang en expliquant que l'ADN d'un échantillon de sang est le «gold standard» car la qualité et la quantité d'ADN dérivé sont meilleures que celles d'un prélèvement buccal (joue). Le Dr Hughes de Mars Veterinary dit que l'ADN dans le sang est en fait très résistant et, en fait, le laboratoire doit élever la température de l'ADN à près d'ébullition à plusieurs reprises pendant les analyses SNP. La société utilise également des tubes en plastique spécialement conçus pour protéger le tube de sang en transit.
Les tests sur écouvillon de joue reçoivent leurs propres critiques. Les écouvillonnages buccaux ont un taux d'échec plus élevé en raison de la variation de l'échantillonnage du propriétaire, comme le fait de ne pas collecter suffisamment de cellules. De plus, en raison des bactéries présentes dans la bouche des chiens, il existe un risque de croissance bactérienne si les échantillons ne sont pas manipulés correctement.
Viennent ensuite les critiques des consommateurs. Un thème récurrent des clients mécontents est que les résultats d'un test ADN n'ont pas permis de trouver une prépondérance d'une race particulière chez leurs chiens «de race mixte très mélangée». (Voir les sections ci-dessous.)
Une autre est liée au fait que certains chiens ne ressemblent en rien aux races détectées par leurs tests. Il est difficile de se sentir bien avec un résultat qui ne confirme ou n'explique rien sur l'apparence physique ou le comportement du chien - et les explications des entreprises sur ce phénomène peuvent être insatisfaisantes.
Le site Web du Wisdom Panel indique:«De nombreuses parties du génome canin sont susceptibles d'être inobservables ou cachées en ce qui concerne la détermination des traits. Cela peut se produire pour n'importe quel nombre de gènes déterminant les traits. En termes simples, un chien de race mixte peut être un mélange de trois ou quatre races, mais avoir peu de traits évidents d'une ou plusieurs de ces races. »
MMIG’s explique :« Canine Heritage Breed Test ne fonctionne que pour les races qui ont été validées. Si la composition raciale de votre animal contient des races non validées, le test peut identifier des races antérieures dans l'ascendance de votre chien. Cela peut entraîner l'identification de races apparemment improbables pour la composition de votre animal. Quelle est la validité des résultats ?
Pour obtenir le point de vue d'un expert indépendant sur l'ADN canin, nous avons interviewé Beth Wictum, directrice du Laboratoire de génétique vétérinaire de l'Université de Californie-Davis School of Veterinary Medicine. Wictum travaille à l'université depuis 30 ans. Elle a participé et été témoin de l'évolution de la science qui permet d'identifier un animal par l'étude de ses tissus; au cours de son mandat, "l'état de l'art" est passé du typage sanguin au séquençage du génome.
Invité à commenter les tests d'identification mixtes, Wictum a souligné que les tests ne sont aussi bons que la base de données de chaque entreprise; c'est-à-dire que si une race n'est pas représentée dans la base de données d'une entreprise, le test identifiera la prochaine correspondance la plus proche. Elle explique en disant que les chiens de race pure, en particulier les races pures enregistrées, ont été gérés de manière intensive et ont un pool génétique limité.
"La plupart des races ont été créées par une sélection intense au cours des dernières centaines d'années, il n'y a donc pas eu assez de temps pour qu'elles divergent par des mutations", dit-elle. Les différences entre les races résident dans l'élevage sélectif par les éleveurs pour la morphologie (structure) ou le comportement. Par conséquent, le test de race idéal serait celui qui examine les traits qui caractérisent chaque race et les rendent uniques.
« Le domaine de la génétique canine est encore jeune; le génome du chien n'a été séquencé qu'il y a environ cinq ans », dit-elle. "Nous commençons tout juste à identifier les gènes responsables de divers traits."
Comme de nombreux scientifiques dans ce domaine, Wictum est enthousiasmé par la possibilité d'identifier la base génétique de diverses maladies. Elle dit que le laboratoire de génétique vétérinaire de l'UC Davis et le laboratoire Bannasch (également à l'UC Davis) "identifient la base génétique de diverses maladies, qui peuvent ensuite être proposées comme tests au public. Si vous savez quelles maladies peuvent survenir, vous pourrez faire tester votre animal pour voir s'il est porteur de la mutation."
Son conseil concernant les tests ADN métis ? «Bien que ces tests puissent indiquer des races qui ont contribué à la composition génétique de votre animal, vous devez réaliser qu'ils ne sont pas précis à 100% - et je ne pense pas qu'ils prétendent l'être. Si vous avez de l'argent à dépenser et que vous voulez le faire juste pour le plaisir, alors allez-y et faites-le. »
Certains propriétaires disent que les tests de race n'en valent pas la peine
Laura Pescador de Denver, Colorado, a commandé le test Canine Heritage pour Misha, son "mélange mystérieux de 60 livres, noir et feu, au nez carré, aux cheveux courts, aux grandes oreilles, à la poitrine profonde et aux yeux bicolores" en mai 2008. Laura a estimé que la combinaison de races qui lui avait été annoncée lorsqu'elle a adopté Misha était peu probable (berger australien/retriever du labrador); elle espérait également recevoir un morceau de papier disant que Misha n'était pas un mélange de pit-bulls, "Pas parce que je ne les aime pas, mais à cause de la législation spécifique à la race de ma ville." Laura a été déçue de recevoir une "lettre d'excuses" avec des résultats indiquant que le test n'était pas concluant ! Sur son certificat, à côté de « Primaire », il y avait écrit « Race non testée », tandis que les deux autres catégories étaient vides.
Scamper, Monty et Rainey sont trois chiens de race mixte appartenant au vétérinaire J.C. Burcham, d'Olathe, Kansas. Au début de 2008, elle a soumis des échantillons de sang pour chaque chien au test Wisdom Panel. Le Dr Burcham était à peu près sûr que Monty était "plusieurs générations de cabots se reproduisant avec des cabots" et avait peu d'attentes pour ses résultats. Elle appelle Scamper un mélange Jack Russell / Basenji / Beagle, alors elle s'attendait à voir quelque chose comme ça, ou même une race de terrier. Rainey a été retrouvé alors qu'il était un chiot dans la Virginie rurale, mourant de faim avec deux compagnons de portée, qui ressemblaient tous les trois à des Border Collies.
Lorsque les résultats sont arrivés, le Dr Burcham a été déçu. "J'avais l'impression que c'était une perte totale d'argent ! Rainey fait clairement partie du Border Collie, et c'est à peu près le seul résultat fiable que j'ai vu. Deux de mes trois chiens se sont avérés «trop complexes» pour être identifiés. J'aurais pu te le dire ! C'est pourquoi j'ai payé pour le test. Les résultats de Rainey ont montré "quelques" Border Collie; cependant, elle a montré des traces lointaines de Briard, Cairn Terrier, Great Dane et Keeshond. Le test de Monty a révélé des traces lointaines de Malamute d'Alaska, de Beagle, de Bearded Collie, de Chow Chow et de Smooth Fox Terrier, tandis que celui de Scamper a montré des traces de Briard, de Curly-Coated Retriever et de Shetland Sheepdog.
La principale déception du Dr Burcham a été de voir Briard chez deux de ses chiens, ce qui était peu probable, à son avis. Elle était également ennuyée que Scamper et Monty aient été surnommés "des chiens de race mixte extrêmement complexes". Avec seulement 10 à 15 % des chiens de races mixtes entrant dans cette catégorie (selon Mars Veterinary), comment pourrait-elle en avoir deux ?
J'ai partagé la déception du Dr Burcham avec le Dr Hughes, la consultante de Mars Veterinary, et elle a proposé non seulement de regarder, mais aussi de refaire les trois tests. Dans l'année qui s'est écoulée depuis le Dr.
Burcham a soumis les échantillons, 23 races supplémentaires ont été ajoutées à la base de données Mars Veterinary et ses algorithmes ont été modifiés. L'entreprise avait découvert que le programme décomposait les chiens en un grand nombre de petits morceaux, "perdant la forêt à travers les arbres", entraînant des faux positifs. Les résultats sont désormais généralement un plus petit nombre de races et potentiellement en plus grandes "quantités".
Lorsque le test de Rainey a été exécuté à nouveau, Briard et Cairn Terrier n'apparaissent pas; il s'agissait très probablement de faux positifs. Border Collie est passé au niveau Significatif (parent), et Great Dane et Keeshound se sont présentés au niveau Intermédiaire (grand-parent). Les résultats de Monty ont montré que Beagle et Chow passaient au niveau intermédiaire (grand-parent) ; les autres races étaient toujours évidentes mais ne pouvaient pas être appelées avec confiance, elles étaient donc probablement des faux positifs lors du premier test.
Les nouveaux résultats de Scamper ont toujours révélé un "chien très mélangé". Curly-Coated Retriever est passé au niveau intermédiaire (grand-parent) et Golden Retriever est apparu au niveau mineur. Briard et Sheltie faisaient potentiellement partie de son histoire lointaine ou de faux positifs. Le berger anatolien et le bouvier australien ont également été détectés, ce qui, selon le Dr Hughes, était plus probable que Briard et Sheltie.
Nancy Kerns intervient
Bien sûr, lorsque l'auteure Lisa Rodier a proposé l'idée d'écrire un article sur les tests d'identification des races mixtes, [ voulait faire tester mon chien de race mixte, Otto - vous savez, juste pour le plaisir du journalisme ! Mais quel test devons-nous commander, auprès de quelle société ? Nous avons rapidement décidé de commander le produit le plus complet auprès de chacune des deux sociétés leaders du secteur et de comparer les résultats.
Otto avait un rendez-vous chez le vétérinaire à venir, que j'ai utilisé comme une opportunité pour faire prélever son sang pour le Mars Veterinary Wisdom Panel. Nous avons suivi le protocole normal :j'ai payé le vétérinaire pour la prise de sang et le test; son personnel a envoyé l'échantillon au laboratoire et m'a donné un numéro d'identification de test afin que je puisse vérifier la progression du test à l'aide du site Web Wisdom Panel.
Le lendemain, j'ai amené Otto avec moi à PETCO pour acheter un kit de test pour le test Canine Heritage "XL" de MMIG (cette société a depuis été rachetée par Wisdom Panel). Le personnel du service de toilettage de PETCO a été formé par MMIG pour collecter des écouvillons de joues. Suite à la visite chez le vétérinaire la veille, Otto était nerveux, alors j'ai récupéré le frottis buccal moi-même (mais j'ai demandé à un membre du personnel de PETCO de poser avec l'échantillon et son enveloppe postale, vous savez, pour la science).
Suspense du test ADN
L'attente des résultats était atroce, d'autant plus que Canine Heritage m'a envoyé un e-mail le lendemain de l'envoi du frottis buccal, confirmant sa réception dans son laboratoire de Davis, en Californie (j'habite à environ 70 miles de Davis). Cela m'a donné l'idée que je pourrais bientôt recevoir des résultats - mais il a fallu sept semaines complètes pour les recevoir par la poste ! (MMIG dit que les résultats devraient arriver dans six à huit semaines; c'est juste l'anticipation qui a rendu cette attente interminable. Plus le fait que vous ne pouvez pas obtenir les résultats en ligne.) J'ai consulté le site Web pour les résultats du Wisdom Panel tous les jours. À peine trois semaines après qu'Otto eut fait sa prise de sang, j'ai vu que les résultats étaient complets et j'ai pu télécharger le fichier Adobe Acrobat qui les contenait.
Alors ? Qu'est-ce que la race est Otto ?
Les résultats du Wisdom Panel ont déclaré:"L'analyse a révélé qu'Otto est un chien assez mixte et nous n'avons trouvé aucune preuve d'un parent ou d'un grand-parent de race pure." (Je pense que je le savais !) Il n'y a eu aucun résultat au niveau « Significatif » ou « Intermédiaire ». Cependant, au niveau « Mineur », ces quatre races sont apparues :Berger Allemand, *Basenji, *Chow Chow et *Border Collie. Les astérisques indiquaient « Quantité mineure détectée avec un niveau de confiance faible. Ces résultats ne sont pas inclus dans les calculs de précision. (Moi :"Basenji ?!")
Les résultats Canine Heritage n'ont rien montré dans la catégorie "Primaire", Chow Chow dans la catégorie "Secondaire", et Caniche et Border Collie "In the Mix". (Moi :"CANICHE ? !")
Mes attentes
J'aurais deviné qu'Otto avait du berger allemand en lui, et je m'attendais même à du Chow Chow. Il a définitivement une queue de type GSD et ses oreilles sont très Chow. Lorsqu'il est trempé et que ses cheveux sont lissés, sa silhouette ressemble un peu à celle d'un Golden Retriever. Et j'étais certain qu'il devait y avoir une race de terrier en lui. Sinon, comment expliquez-vous ce visage flou ?
Le refuge où je l'ai adopté a deviné qu'il était Airedale et Border Terrier. (Je leur donne une pause; il n'avait que cinq mois environ et peu quand ils l'ont eu.) Bien que cette race n'apparaisse ni dans la base de données Canine Heritage ni dans la base de données Wisdom Panel, l'auteur Lisa Rodier recherchait un berger picard (Berger Picard) résultat; elle pense qu'il est un sonneur pour le chien Winn-Dixie. Personne n'a deviné Border Collie, Caniche ou Basenji.
Pourquoi les tests ADN n'ont-ils pas fonctionné ?
Comment les deux entreprises peuvent-elles avoir des résultats si différents pour Otto ?
Nous avons demandé à Theresa Brady, porte-parole du MMIG, de répondre à cette question. Elle a répondu:«Chaque entreprise a développé son test de manière indépendante, il existe donc un certain nombre de facteurs qui peuvent entraîner la reconnaissance de différentes races chez un chien particulier. Au cours de la phase de recherche, chaque entreprise doit identifier un ensemble de marqueurs ADN qui caractérisent les différences d'une race à l'autre. Ensuite, ces marqueurs doivent être caractérisés dans un ensemble de chiens représentant les races pures.
«Non seulement ces marqueurs sont différents d'une entreprise à l'autre, mais le nombre et la source des chiens de race sont différents. Aucune entreprise ne peut tester chaque chien de race pure représentant une race, et chaque entreprise aura développé un logiciel utilisé pour comparer ces marqueurs génétiques entre les races.
"Certaines races, cependant, sont étroitement liées car elles ont été développées à partir du croisement de races plus anciennes et plus établies. Par exemple, les Boston Terriers ont été développés à partir du croisement du Bulldog anglais et du White Terrier anglais. Ainsi, selon le logiciel, les marqueurs établis pour les races pures et la population de races dans la base de données de chaque entreprise, un même chien peut tester "Boston Terrier" avec une entreprise et "English Bulldog" avec une autre.
"Certaines races sont apparentées parce qu'elles sont issues d'une lignée commune, comme beaucoup de ces races développées en Asie. Très tôt, nous (MMIG) avons reconnu que le Chow Chow, l'Akita, le Husky sibérien, le Shar-Pei chinois et même le Shih-Tzu peuvent se regrouper en un seul type de race général. Nous avons donc développé un programme et une procédure d'analyse améliorés pour séparez-les. Il n'est donc pas surprenant que les entreprises rapportent des résultats légèrement différents, en particulier pour les races qui n'ont qu'une petite représentation dans l'animal de compagnie de race mixte. »
Abordant tous les résultats qui apparaissent dans la section "Secondaire" d'un rapport (où ils ont détecté Chow Chow à Otto), le paquet de résultats MMIG (Canine Heritage) indique :"Cette catégorie signale des races qui pourraient être facilement reconnaissables chez votre chien. Bien que ces races puissent ou non avoir une forte influence sur votre animal de compagnie, chaque race répertoriée représente moins que la majorité de l'ADN de votre chien."
Abordant les résultats qui apparaissent dans la section "Dans le mélange" d'un rapport (où ils ont détecté le caniche et le border collie à Otto), le paquet Canine Heritage indique :"Cette dernière catégorie identifie les races qui ont le moins d'influence sur la composition de votre animal. . Ils apparaissent toujours, en quantités faibles et mesurables, dans l'ADN de votre animal. Si les résultats de votre animal n'identifient que les races de cette catégorie, il est possible que votre animal soit composé de tant de races que seules de petites influences de chaque race peuvent être détectées."
Le paquet de résultats de Mars Veterinary (Wisdom Panel) explique :« En raison de la complexité de la génétique et de la transmission des gènes dominants et récessifs de génération en génération, chaque trait des races que nous avons trouvées peut ne pas toujours être visuellement apparent. Il est important de passer du temps à observer de près l'apparence et la personnalité d'Otto. Réfléchissez aux traits d'Otto qui peuvent refléter une combinaison des races détectées et à ceux qui semblent refléter une seule des races individuelles."
Notre avis sur les tests de race
Je dois dire que j'ai trouvé l'ensemble de l'exercice très intéressant, mais qui n'en valait pas nécessairement le coût. Étant donné que les résultats pour mon chien très métissé étaient si faibles, l'idée qu'ils pourraient m'aider à anticiper certains problèmes de santé ou de comportement liés aux races trouvées n'est pas très convaincante. Mais je doute que ce soit la raison pour laquelle la plupart des gens commandent les tests ; Je pense que la plupart d'entre nous sont simplement curieux.
Ayant passé tant de temps à examiner et à admirer les réalisations technologiques qui ont contribué au développement de ces tests ADN, Lisa Rodier avait peur que je me moque de la science derrière ces tests parce que j'étais si sceptique quant aux races détectées dans la lignée d'Otto. Ce n'est pas ça; Je fais confiance à la science. Je crois qu'il y a des traces de ces races (et de bien d'autres) à Otto. C'est juste que je savais déjà qu'il était un chien très mélangé, juste d'un regard (gratuit !) sur lui. And if he wasn’t such a mixed bag – if he looked a lot like one particular breed, I’d probably be satisfied with the idea that he was mostly that breed; I wouldn’t spend $100-plus to confirm it.
That said, I must admit I will be interested to see how the results might change in a few years, after these companies put thousands and thousands more dogs into their databases. Which breeds will “fall off” of Otto’s results as meaningless “background noise”? Will the Picardy Shepherd be added? It could still develop that Otto is a limp-eared Picardy who fell out of a French tourist’s car somewhere in the Northern California wine country…We’ll check back with these companies in a few years, and let you know.
– Nancy Kerns
Dog DNA Testing FAQs
Canine mixed breed tests seem to be a very emotional topic. Those who have used the tests and have gotten the results they expected tend to be proponents, while those who received weak results or results that didn’t seem to square with the dog’s appearance tend to regret the purchase. But does that mean the tests don’t work? Here’s a stab at trying to explain some of what might be going on.
Breed results are reported in levels; Why is my dog only getting “minor” or “trace” breeds and no strong hits?
Dr. Hughes explained that most likely the dog’s parents and grandparents were themselves mixed breed, and a portion of the dog’s ancestry can be mixed beyond three generations which, for Mars Veterinary, is the extent of the company’s confidence. There is also the possibility that a breed is not covered in the database (for example, none of the tests’ databases include Rat Terrier) so the test will look for the most closely related breed.
My dog looks like X, but the test says she’s Y…
Dr. Hughes explains that we want to associate a particular trait with one breed, but in actuality, it could be coming from a number of breeds. And when we move across breeds, combinations of genes can create very unusual outcomes.
One way she looks at the issue is first looking at a dog’s traits, defining what genes are necessary to get those traits, and then asking whether we can get those genes in a particular breed? For example, the merle color pattern, very common in Australian Shepherds, comes from a single gene, and a dog need only have one copy of that gene to exhibit that color pattern, And guess what? Dachshunds, Chihuahuas, and Great Danes can all provide that gene.
Black and tan coats are commonly associated with Rottweilers and Dobermans. But Chihuahuas, Cocker Spaniels, Dachshunds, and Poodles all carry this gene mutation. But in this case, it is recessive, so two copies must come together for
us to actually see that color pattern.
Meg Retinger of BioPet also points out that in some very mixed dogs, you might only see very subtle traits, such as the shape of the ear or the eyes. Her son’s dog tested as showing Beagle, yet she looks very much like a Labrador. When she howls, however, she sounds like pure Beagle!
My dog is a Labradoodle (Labrador Retriever-Poodle cross), so why doesn’t the test say she’s a 50/50 mix?
We let Theresa Brady of MMIG address this, as she herself owns a Labradoodle. When she tested her dog using the Canine Heritage test, the results showed that Poodle was a Secondary breed, with Labrador Retriever “In the Mix.”
She explains, “You should know that my dog came from a breeder who claimed that the dog was seventh generation Labradoodle, which means that neither of her parents was a purebred (purebred Poodle or Retriever) and neither of their parents were purebred and so on. It makes sense, then, that she had nothing show up in Primary.” When I asked why the Poodle was Secondary, but not the Retriever, her guess was that the breeder probably crossed back more Poodle, looking for a more hypoallergenic coat. Dr. Hughes adds, “When breeding Labradoodle to Labradoodle, the “amount’ of Lab or Poodle genes passed down is random chance (think of a Pachinko machine). Testing the dog’s littermates may show very different proportions of each of these breeds. That being said, some ‘Labradoodle’ breeders are back-crossing Labradoodles to Poodles to change the size or coat of the dogs. I have seen some really strange looking Labradoodles!”
How can dog DNA tests get better?
Increasing the size of the database, increasing the number of markers, and overall innovations in technology will see the tests become better tools. Also, as research continues on canine genetics, a better understanding of genes and how they relate to various breed traits will play a role in making a better test.
Lisa Rodier lives in Alpharetta, Georgia, with her husband and two Bouviers.
